菊花性凉，味苦辛，有清热解毒、化痰止咳、清肝明目、疏散风热的功效，可治疗因肝火上亢所致的头痛、外感风热造成的感冒，有效缓解眼酸痛和视疲劳，对神经性头痛、头晕也有一定的疗效。常喝菊花茶，还能扩张动脉和增加冠脉流量，降低血压，长期饮用也可降低胆固醇。
菊花中含一些挥发油，尤其白菊花中含有龙脑、樟脑、菊油环酮等成分，具有明显的降压和抗菌消炎作用。另据介绍，菊花茶中含有0.9％的微量脂肪，可与菊花中的黄酮共同作用于人体，从而发挥清热解毒的功效。不过，也有研究显示，菊花茶中的微量脂肪有可能会使人体发寒，并使人体免疫力下降，所以喝菊花茶应适量，不宜多饮。
不同菊花做茶时的作用也不同。贡菊具有清肝明目的作用，白菊疏散风热的效果最强，杭菊更有利于清热利咽。野菊花的清热解毒功能最为突出，对缓解上火导致的口腔溃疡、牙痛、口臭等都有效，但因其寒凉作用较强，建议适量饮用。